Query Tables



Search

Interactive Table 1: Validated SNP-transcript pairs with evidence of an eQTL and a transcriptional response to the vaccine.


ProbeIDrsIDGeneIDMinor Allele (D)Minor Allele (V)MAF (D)MAF (V)pGene (D)pGene (V)pDay (D)pDay (V)Beta (D)Beta (V)
G
G
0.26
0.241
0.00E+00
1.98E-04
4.53E-06
-0.188
-0.315
G
G
0.208
0.177
0.00E+00
2.16E-04
3.85E-06
-0.197
-0.273
A
A
0.271
0.264
0.00E+00
1.89E-04
4.57E-06
0.174
0.296
G
G
0.289
0.295
0.00E+00
2.39E-04
5.23E-06
-0.159
-0.246
A
A
0.276
0.332
1.24E-08
1.72E-03
8.79E-10
-0.588
-0.317
G
G
0.276
0.332
1.24E-08
1.72E-03
8.79E-10
0.588
0.317
C
C
0.375
0.345
6.66E-16
3.17E-05
7.68E-03
-0.344
-0.275
G
G
0.375
0.345
6.66E-16
3.17E-05
7.68E-03
-0.344
-0.275
A
A
0.375
0.341
3.11E-15
3.17E-05
7.72E-03
0.344
0.273
G
G
0.411
0.368
4.69E-12
3.04E-05
7.71E-03
-0.288
-0.246
A
A
0.411
0.364
3.28E-12
3.04E-05
7.78E-03
0.288
0.242
G
G
0.284
0.245
1.01E-12
4.61E-05
7.99E-03
-0.265
-0.261
A
A
0.286
0.25
3.20E-12
3.27E-05
7.98E-03
0.273
0.254
G
G
0.219
0.2
0.00E+00
7.19E-07
2.87E-04
-0.353
-0.417
G
G
0.219
0.2
0.00E+00
7.19E-07
2.87E-04
-0.353
-0.417
A
A
0.219
0.2
0.00E+00
7.19E-07
2.87E-04
0.353
0.417
A
A
0.208
0.2
0.00E+00
7.34E-07
2.87E-04
0.377
0.417
G
G
0.208
0.205
0.00E+00
8.12E-07
2.87E-04
-0.371
-0.418
A
A
0.182
0.186
0.00E+00
6.64E-07
3.29E-04
0.333
0.406
A
A
0.094
0.105
0.00E+00
7.97E-07
4.05E-04
0.355
0.477
A
A
0.281
0.236
3.26E-10
7.83E-04
1.16E-12
-0.136
-0.281
A
A
0.271
0.218
4.51E-10
7.84E-04
1.08E-12
-0.134
-0.291
A
A
0.281
0.236
9.51E-11
1.99E-03
1.42E-13
-0.065
-0.206
A
A
0.271
0.218
2.21E-09
2.01E-03
1.14E-13
-0.063
-0.21
G
G
0.396
0.382
0.00E+00
4.52E-04
1.96E-12
-0.327
-0.724
G
A
0.443
0.495
4.22E-15
5.07E-04
3.87E-12
0.223
0.519
G
G
0.208
0.214
3.19E-13
4.44E-16
0.00E+00
0.208
0.315
A
A
0.208
0.2
9.99E-16
4.44E-16
0.00E+00
-0.174
-0.384
A
A
0.203
0.191
0.00E+00
4.44E-16
0.00E+00
-0.18
-0.422
G
G
0.214
0.223
1.01E-12
4.44E-16
0.00E+00
0.198
0.317
A
A
0.207
0.223
1.02E-13
2.22E-15
0.00E+00
-0.2
-0.34
A
A
0.211
0.218
4.41E-13
4.44E-16
0.00E+00
-0.202
-0.325
A
A
0.266
0.245
0.00E+00
0.00E+00
0.00E+00
0.082
0.243
A
A
0.266
0.245
0.00E+00
0.00E+00
0.00E+00
0.082
0.243
G
G
0.266
0.245
0.00E+00
0.00E+00
0.00E+00
-0.082
-0.243
G
G
0.266
0.245
0.00E+00
0.00E+00
0.00E+00
-0.082
-0.243
A
A
0.266
0.245
0.00E+00
0.00E+00
0.00E+00
0.082
0.243
A
A
0.266
0.245
0.00E+00
0.00E+00
0.00E+00
0.082
0.243
G
G
0.266
0.245
0.00E+00
0.00E+00
0.00E+00
-0.082
-0.243
A
A
0.266
0.245
0.00E+00
0.00E+00
0.00E+00
0.082
0.243
G
G
0.266
0.25
0.00E+00
0.00E+00
0.00E+00
-0.082
-0.235
G
G
0.266
0.25
0.00E+00
0.00E+00
0.00E+00
-0.082
-0.235
A
A
0.271
0.245
0.00E+00
0.00E+00
0.00E+00
0.08
0.243
G
G
0.271
0.245
0.00E+00
0.00E+00
0.00E+00
-0.08
-0.243
C
A
0.484
0.445
0.00E+00
2.19E-03
3.33E-16
-0.378
-0.701
G
G
0.448
0.386
1.26E-13
2.17E-03
2.22E-16
0.342
0.631
A
A
0.448
0.382
1.31E-13
2.17E-03
1.11E-16
-0.342
-0.625
G
G
0.448
0.382
1.31E-13
2.17E-03
1.11E-16
0.342
0.625
A
A
0.464
0.477
4.63E-11
2.22E-03
2.22E-16
0.338
0.523
A
A
0.401
0.473
6.02E-14
2.15E-03
2.22E-16
0.351
0.635
A
A
0.469
0.418
9.17E-10
2.15E-03
2.22E-16
-0.324
-0.513
A
A
0.432
0.368
4.21E-12
2.15E-03
2.22E-16
-0.314
-0.568
A
A
0.411
0.332
5.90E-10
2.19E-03
2.22E-16
-0.32
-0.563
A
A
0.417
0.345
5.31E-11
2.18E-03
2.22E-16
-0.304
-0.59
A
A
0.276
0.277
2.22E-16
7.81E-03
1.80E-10
0.104
0.197
A
A
0.214
0.205
1.25E-11
8.13E-03
1.91E-10
0.103
0.173
G
G
0.062
0.059
2.95E-10
6.02E-04
7.25E-07
-0.094
-0.293
A
A
0.135
0.127
2.13E-13
4.11E-04
9.93E-05
0.341
0.612
A
A
0.135
0.127
2.13E-13
4.11E-04
9.93E-05
0.341
0.612
G
G
0.135
0.127
2.13E-13
4.11E-04
9.93E-05
-0.341
-0.612
G
G
0.135
0.127
2.13E-13
4.11E-04
9.93E-05
-0.341
-0.612
G
G
0.135
0.127
2.13E-13
4.11E-04
9.93E-05
-0.341
-0.612
C
C
0.141
0.127
2.13E-13
4.09E-04
9.93E-05
-0.336
-0.612
G
G
0.13
0.124
2.71E-12
4.06E-04
5.92E-05
-0.363
-0.612
G
G
0.13
0.118
3.11E-10
4.14E-04
1.02E-04
-0.342
-0.548
G
G
0.13
0.118
3.11E-10
4.14E-04
1.02E-04
-0.342
-0.548
A
A
0.125
0.123
3.69E-12
3.96E-04
1.01E-04
0.366
0.603
G
G
0.141
0.132
5.68E-14
4.12E-04
1.01E-04
-0.325
-0.603
A
A
0.141
0.132
5.68E-14
4.12E-04
1.01E-04
0.325
0.603
A
A
0.142
0.134
9.25E-14
5.00E-04
8.12E-05
0.324
0.605
A
A
0.146
0.15
1.81E-12
4.13E-04
9.94E-05
0.307
0.55
G
G
0.135
0.123
1.11E-08
4.16E-04
9.95E-05
-0.28
-0.497
G
G
0.417
0.45
9.57E-13
1.94E-09
1.47E-08
-0.154
-0.153
A
A
0.375
0.418
2.01E-08
1.82E-09
1.38E-08
0.161
0.12
G
G
0.438
0.459
1.94E-09
1.80E-09
1.31E-08
-0.146
-0.115
G
G
0.448
0.45
1.34E-08
2.53E-09
1.41E-08
-0.126
-0.122
G
G
0.344
0.25
0.00E+00
9.81E-04
1.81E-06
-0.48
-1.028
G
G
0.344
0.25
0.00E+00
9.81E-04
1.81E-06
-0.48
-1.028
A
A
0.344
0.25
0.00E+00
9.81E-04
1.81E-06
0.48
1.028
A
A
0.349
0.264
0.00E+00
9.86E-04
1.77E-06
0.471
0.978
C
C
0.349
0.259
0.00E+00
9.86E-04
1.73E-06
-0.471
-1.016
A
A
0.349
0.264
0.00E+00
9.86E-04
1.77E-06
0.471
0.978
G
G
0.391
0.3
4.05E-13
1.03E-03
1.65E-06
-0.453
-0.712
C
C
0.391
0.3
4.05E-13
1.03E-03
1.65E-06
-0.453
-0.712
A
A
0.339
0.245
0.00E+00
9.49E-04
1.79E-06
0.465
1.016
A
A
0.339
0.245
0.00E+00
9.49E-04
1.79E-06
0.465
1.016
A
A
0.339
0.255
0.00E+00
9.49E-04
1.84E-06
0.465
0.989
G
G
0.333
0.25
0.00E+00
9.64E-04
1.81E-06
-0.46
-1.028
A
A
0.354
0.268
0.00E+00
1.04E-03
1.73E-06
0.455
0.954
G
G
0.344
0.264
0.00E+00
9.54E-04
1.77E-06
-0.456
-0.978
G
G
0.344
0.264
0.00E+00
9.54E-04
1.77E-06
-0.456
-0.978
G
G
0.349
0.268
0.00E+00
1.01E-03
1.73E-06
-0.441
-0.954
A
A
0.349
0.259
0.00E+00
1.01E-03
1.67E-06
0.441
0.976
A
A
0.37
0.268
0.00E+00
9.64E-04
1.82E-06
0.424
0.804
A
A
0.391
0.341
5.44E-15
1.20E-03
1.75E-06
0.404
0.725
C
C
0.387
0.317
5.11E-15
1.41E-03
2.57E-06
-0.397
-0.714
G
G
0.385
0.314
2.44E-15
1.02E-03
1.95E-06
-0.386
-0.718
A
A
0.411
0.386
4.10E-08
1.14E-03
2.07E-06
0.38
0.483
G
G
0.411
0.391
2.76E-08
1.14E-03
2.08E-06
-0.38
-0.478
A
A
0.411
0.386
4.10E-08
1.14E-03
2.07E-06
0.38
0.483
G
G
0.401
0.391
1.82E-08
1.15E-03
1.29E-06
-0.398
-0.588
A
A
0.38
0.3
5.77E-15
9.66E-04
1.96E-06
0.413
0.697
G
G
0.359
0.368
1.23E-08
1.19E-03
1.30E-06
-0.386
-0.631
G
G
0.406
0.364
1.08E-12
1.89E-04
8.88E-16
0.255
0.196
G
G
0.406
0.364
1.08E-12
1.89E-04
8.88E-16
0.255
0.196
G
G
0.198
0.205
1.12E-08
2.22E-04
1.11E-15
0.366
0.249
G
G
0.203
0.209
2.00E-08
2.19E-04
1.11E-15
0.364
0.243
A
A
0.193
0.214
4.82E-08
2.21E-04
1.22E-15
-0.376
-0.234
A
A
0.396
0.345
0.00E+00
2.10E-03
7.07E-04
-0.306
-0.339
A
A
0.422
0.368
0.00E+00
2.06E-03
7.16E-04
-0.281
-0.345
G
G
0.401
0.364
0.00E+00
2.10E-03
7.09E-04
0.307
0.36
A
A
0.432
0.377
0.00E+00
2.12E-03
7.12E-04
-0.317
-0.366
C
C
0.464
0.422
0.00E+00
2.13E-03
8.33E-04
0.317
0.397
G
A
0.495
0.445
0.00E+00
2.12E-03
7.16E-04
-0.28
-0.383
A
A
0.474
0.423
0.00E+00
2.11E-03
7.21E-04
-0.313
-0.397
G
A
0.484
0.445
0.00E+00
2.12E-03
7.16E-04
-0.278
-0.383
G
G
0.474
0.423
0.00E+00
2.11E-03
7.21E-04
0.313
0.397
G
A
0.495
0.455
0.00E+00
2.07E-03
7.17E-04
-0.278
-0.372
G
G
0.49
0.445
0.00E+00
2.10E-03
7.05E-04
0.293
0.377
G
G
0.458
0.445
1.05E-09
1.93E-03
7.25E-04
0.259
0.231
A
A
0.411
0.468
0.00E+00
2.02E-03
6.66E-04
0.284
0.358
G
G
0.396
0.459
0.00E+00
2.09E-03
6.79E-04
-0.273
-0.341
A
A
0.38
0.445
0.00E+00
1.94E-03
6.72E-04
0.238
0.345
G
A
0.479
0.486
1.99E-08
2.13E-03
7.11E-04
-0.205
-0.207
G
G
0.396
0.368
8.29E-12
2.08E-03
7.14E-04
-0.22
-0.242
G
G
0.365
0.355
4.17E-10
2.03E-03
7.22E-04
-0.212
-0.226
G
G
0.375
0.359
3.27E-10
2.05E-03
7.24E-04
-0.213
-0.23
A
A
0.26
0.241
2.82E-08
5.36E-03
6.61E-03
-0.121
-0.09
A
A
0.458
0.468
1.75E-08
1.98E-08
1.15E-04
0.137
0.14
C
C
0.359
0.332
1.11E-15
3.90E-04
1.00E-08
0.114
0.129
A
A
0.359
0.327
1.67E-15
3.90E-04
1.06E-08
-0.114
-0.131
G
G
0.339
0.318
1.53E-14
3.90E-04
1.09E-08
0.114
0.123
G
G
0.479
0.464
3.78E-08
7.11E-03
2.54E-05
-0.167
-0.123
A
A
0.073
0.074
1.26E-13
6.06E-03
4.11E-13
0.407
0.579
A
A
0.078
0.114
0.00E+00
6.34E-03
2.26E-13
0.382
0.517
A
A
0.312
0.282
0.00E+00
2.03E-03
5.46E-04
-0.541
-1.299
A
A
0.365
0.414
3.23E-12
2.20E-03
5.60E-04
0.086
0.131
G
G
0.365
0.414
3.23E-12
2.20E-03
5.60E-04
-0.086
-0.131
G
G
0.068
0.064
0.00E+00
7.24E-11
4.60E-03
0.901
0.755
A
A
0.427
0.45
1.07E-10
2.61E-06
4.07E-05
0.109
0.183
G
G
0.458
0.491
3.98E-09
2.61E-06
4.07E-05
-0.111
-0.164
A
A
0.484
0.495
4.96E-09
2.88E-06
4.08E-05
0.103
0.164
A
A
0.448
0.468
3.77E-08
2.43E-06
3.96E-05
0.114
0.154
A
A
0.458
0.491
3.98E-09
2.61E-06
4.07E-05
0.111
0.164
A
A
0.458
0.491
3.98E-09
2.61E-06
4.07E-05
0.111
0.164
G
G
0.448
0.468
3.77E-08
2.43E-06
3.96E-05
-0.114
-0.154
G
G
0.379
0.405
0.00E+00
1.62E-13
0.00E+00
0.299
0.417
G
G
0.38
0.409
1.11E-16
7.22E-14
0.00E+00
0.294
0.392
G
G
0.375
0.405
4.44E-16
7.38E-14
0.00E+00
0.291
0.386
G
G
0.365
0.395
0.00E+00
7.48E-14
0.00E+00
0.289
0.402
G
G
0.37
0.4
0.00E+00
7.58E-14
0.00E+00
0.292
0.411
G
G
0.37
0.4
0.00E+00
7.58E-14
0.00E+00
0.292
0.411
A
A
0.146
0.2
0.00E+00
2.99E-07
6.95E-07
0.156
0.175
A
A
0.115
0.173
0.00E+00
3.16E-07
7.57E-07
0.163
0.189
A
A
0.116
0.173
0.00E+00
2.38E-07
7.57E-07
0.163
0.189
A
A
0.203
0.25
3.33E-16
3.11E-07
7.39E-07
0.116
0.169
G
G
0.396
0.273
0.00E+00
4.72E-03
2.27E-05
-0.123
-0.456
G
G
0.453
0.327
0.00E+00
4.86E-03
2.55E-05
-0.122
-0.365
G
G
0.391
0.268
0.00E+00
4.70E-03
2.39E-05
-0.117
-0.442
G
G
0.443
0.323
0.00E+00
4.83E-03
2.64E-05
-0.115
-0.351
G
G
0.328
0.368
0.00E+00
4.85E-05
2.22E-16
0.268
0.518
G
G
0.328
0.364
0.00E+00
4.85E-05
2.22E-16
0.268
0.515
G
G
0.328
0.368
0.00E+00
4.85E-05
2.22E-16
0.268
0.518
G
G
0.328
0.368
7.55E-15
7.95E-09
2.38E-14
0.083
0.231
G
G
0.328
0.364
3.75E-14
7.95E-09
2.55E-14
0.083
0.23
G
G
0.328
0.368
7.55E-15
7.95E-09
2.38E-14
0.083
0.231
A
A
0.239
0.188
2.93E-11
4.55E-04
1.68E-10
0.13
0.112
G
G
0.245
0.191
2.62E-11
5.18E-04
8.11E-11
-0.125
-0.112
A
A
0.245
0.191
2.62E-11
5.18E-04
8.11E-11
0.125
0.112
G
G
0.245
0.193
3.76E-11
5.18E-04
1.66E-10
-0.125
-0.114
G
G
0.245
0.191
2.62E-11
5.18E-04
8.11E-11
-0.125
-0.112
A
A
0.245
0.191
2.62E-11
5.18E-04
8.11E-11
0.125
0.112
G
G
0.245
0.191
2.62E-11
5.18E-04
8.11E-11
-0.125
-0.112
G
G
0.245
0.191
2.62E-11
5.18E-04
8.11E-11
-0.125
-0.112
G
G
0.245
0.191
2.62E-11
5.18E-04
8.11E-11
-0.125
-0.112
A
A
0.245
0.191
2.62E-11
5.18E-04
8.11E-11
0.125
0.112
A
A
0.245
0.191
2.62E-11
5.18E-04
8.11E-11
0.125
0.112
A
A
0.245
0.191
2.62E-11
5.18E-04
8.11E-11
0.125
0.112
C
C
0.245
0.191
2.62E-11
5.18E-04
8.11E-11
-0.125
-0.112
C
C
0.245
0.191
2.62E-11
5.18E-04
8.11E-11
0.125
0.112
G
G
0.245
0.191
2.62E-11
5.18E-04
8.11E-11
-0.125
-0.112
A
A
0.245
0.191
2.62E-11
5.18E-04
8.11E-11
0.125
0.112
G
G
0.245
0.191
2.62E-11
5.18E-04
8.11E-11
-0.125
-0.112
G
G
0.245
0.191
2.62E-11
5.18E-04
8.11E-11
-0.125
-0.112
A
A
0.245
0.191
2.62E-11
5.18E-04
8.11E-11
0.125
0.112
G
G
0.245
0.191
2.62E-11
5.18E-04
8.11E-11
-0.125
-0.112
A
A
0.245
0.191
2.62E-11
5.18E-04
8.11E-11
0.125
0.112
A
A
0.245
0.191
2.62E-11
5.18E-04
8.11E-11
0.125
0.112
G
G
0.245
0.191
2.62E-11
5.18E-04
8.11E-11
-0.125
-0.112
A
A
0.245
0.188
1.95E-11
5.18E-04
1.61E-10
0.125
0.113
G
G
0.247
0.191
2.62E-11
5.77E-04
8.11E-11
-0.126
-0.112
G
G
0.214
0.164
4.60E-08
4.74E-04
6.12E-11
-0.121
-0.104
A
A
0.214
0.164
4.60E-08
4.74E-04
6.12E-11
0.121
0.104
A
A
0.214
0.164
4.60E-08
4.74E-04
6.12E-11
0.121
0.104
G
G
0.25
0.209
8.62E-11
5.18E-04
8.60E-11
-0.122
-0.109
A
A
0.25
0.209
8.62E-11
5.18E-04
8.60E-11
0.122
0.109
G
G
0.25
0.209
8.62E-11
5.18E-04
8.60E-11
-0.122
-0.109
G
G
0.185
0.191
2.62E-11
2.02E-03
8.11E-11
-0.133
-0.112
G
G
0.281
0.214
7.46E-10
5.21E-04
8.01E-11
-0.105
-0.097
A
A
0.068
0.073
0.00E+00
7.55E-11
4.21E-04
0.307
0.455
A
A
0.068
0.064
0.00E+00
7.55E-11
4.11E-04
0.307
0.503
A
A
0.068
0.073
0.00E+00
7.55E-11
4.21E-04
0.307
0.455
G
G
0.068
0.064
0.00E+00
7.55E-11
4.11E-04
-0.307
-0.503
A
A
0.068
0.064
0.00E+00
7.55E-11
4.11E-04
0.307
0.503
G
G
0.052
0.059
0.00E+00
8.40E-11
4.09E-04
-0.383
-0.543
C
C
0.084
0.077
0.00E+00
1.07E-10
3.97E-04
-0.258
-0.423
G
G
0.089
0.082
0.00E+00
7.92E-11
4.15E-04
-0.238
-0.433
G
G
0.089
0.086
0.00E+00
7.92E-11
4.08E-04
-0.238
-0.391
G
G
0.12
0.095
2.22E-16
8.26E-11
4.05E-04
-0.195
-0.354
G
G
0.255
0.273
1.89E-12
1.58E-14
0.00E+00
0.098
0.134
A
A
0.188
0.159
0.00E+00
9.43E-04
3.19E-07
-0.414
-0.463
A
A
0.177
0.155
0.00E+00
1.00E-03
3.19E-07
-0.382
-0.458
A
A
0.177
0.155
0.00E+00
1.00E-03
3.19E-07
-0.382
-0.458
A
A
0.219
0.177
1.11E-15
6.14E-04
2.99E-08
-0.073
-0.227
G
G
0.271
0.245
9.86E-14
6.08E-04
3.64E-08
0.07
0.199
G
G
0.219
0.177
1.11E-15
6.24E-04
2.99E-08
0.07
0.227
A
A
0.232
0.209
3.29E-13
7.00E-04
3.60E-08
-0.069
-0.198
C
C
0.255
0.227
1.88E-12
6.27E-04
4.29E-08
0.062
0.18
G
G
0.234
0.205
6.69E-13
6.14E-04
3.92E-08
0.07
0.189
G
G
0.307
0.373
1.11E-16
2.09E-06
1.09E-06
-0.456
-0.432
A
A
0.292
0.373
6.66E-16
2.15E-06
1.06E-06
0.44
0.418
A
A
0.289
0.373
6.66E-16
2.99E-06
1.06E-06
0.438
0.418
A
A
0.479
0.468
0.00E+00
1.17E-09
0.00E+00
0.198
0.396
G
G
0.484
0.495
0.00E+00
1.20E-09
0.00E+00
-0.185
-0.378
G
G
0.464
0.468
0.00E+00
1.32E-09
0.00E+00
0.199
0.389
A
A
0.458
0.455
0.00E+00
1.41E-09
0.00E+00
-0.198
-0.364
A
A
0.458
0.486
0.00E+00
1.40E-09
0.00E+00
-0.204
-0.39
A
A
0.448
0.473
0.00E+00
1.39E-09
0.00E+00
-0.18
-0.377
A
A
0.495
0.491
1.33E-15
1.22E-09
0.00E+00
-0.158
-0.357
A
G
0.5
0.5
1.14E-14
1.16E-09
0.00E+00
0.145
0.343
A
G
0.495
0.477
4.32E-14
1.31E-09
0.00E+00
-0.157
-0.33
G
A
0.495
0.477
4.32E-14
1.31E-09
0.00E+00
0.157
0.33
A
A
0.469
0.464
0.00E+00
1.13E-09
0.00E+00
-0.15
-0.345
G
A
0.464
0.486
1.23E-13
1.48E-09
0.00E+00
0.148
0.335
C
C
0.438
0.455
2.22E-16
1.31E-09
0.00E+00
0.149
0.346
A
A
0.266
0.291
0.00E+00
4.41E-10
1.83E-13
-0.952
-1.695
A
A
0.268
0.291
0.00E+00
6.13E-10
1.83E-13
-0.95
-1.695
A
A
0.268
0.296
0.00E+00
6.13E-10
0.00E+00
-0.95
-1.705
A
A
0.359
0.359
0.00E+00
6.42E-10
2.09E-13
-0.828
-1.368
G
G
0.365
0.35
3.76E-08
4.85E-10
2.71E-13
-0.643
-0.985
A
A
0.365
0.353
3.67E-08
4.85E-10
9.06E-14
0.643
0.997
A
A
0.365
0.35
3.76E-08
4.85E-10
2.71E-13
0.643
0.985
G
G
0.365
0.35
3.76E-08
4.85E-10
2.71E-13
-0.643
-0.985
A
A
0.365
0.35
3.76E-08
4.85E-10
2.71E-13
0.643
0.985
A
A
0.438
0.445
6.66E-16
3.63E-03
8.86E-05
-0.165
-0.393
G
G
0.417
0.432
0.00E+00
3.64E-03
8.85E-05
0.154
0.408
A
A
0.427
0.409
5.19E-12
3.62E-03
8.88E-05
-0.163
-0.341
G
G
0.464
0.464
1.23E-10
3.56E-03
8.83E-05
0.158
0.317
G
G
0.427
0.445
6.66E-16
3.63E-03
8.86E-05
0.159
0.393
A
A
0.438
0.45
1.34E-11
3.57E-03
8.72E-05
-0.142
-0.33
A
A
0.208
0.168
1.11E-15
3.93E-04
1.80E-10
-0.289
-0.559
G
G
0.365
0.323
3.52E-09
1.22E-15
5.03E-05
0.294
0.148
A
A
0.365
0.332
4.02E-09
1.55E-15
5.70E-05
-0.317
-0.142
C
C
0.359
0.332
4.02E-09
1.55E-15
5.70E-05
0.312
0.142
A
A
0.359
0.332
4.02E-09
1.55E-15
5.70E-05
-0.312
-0.142
A
A
0.37
0.332
4.42E-11
1.33E-15
4.99E-05
-0.298
-0.186
G
G
0.339
0.291
1.85E-09
1.55E-15
4.83E-05
0.3
0.16
A
A
0.339
0.291
1.85E-09
1.55E-15
4.83E-05
-0.3
-0.16
A
A
0.297
0.241
3.12E-08
1.33E-15
5.16E-05
-0.29
-0.177
G
G
0.182
0.186
9.99E-15
8.14E-07
0.00E+00
-0.138
-0.186
A
A
0.49
0.495
0.00E+00
1.25E-07
6.73E-10
-0.13
-0.254
A
A
0.375
0.395
0.00E+00
1.32E-07
5.65E-10
0.148
0.256
A
A
0.49
0.495
0.00E+00
1.25E-07
6.73E-10
-0.13
-0.254
A
A
0.323
0.368
0.00E+00
2.20E-07
6.25E-10
0.149
0.235
G
G
0.323
0.368
0.00E+00
2.20E-07
6.25E-10
-0.149
-0.235
A
A
0.49
0.495
0.00E+00
3.63E-04
1.04E-13
-0.309
-0.55
A
A
0.375
0.395
0.00E+00
3.99E-04
8.22E-14
0.37
0.536
A
A
0.49
0.495
0.00E+00
3.63E-04
1.04E-13
-0.309
-0.55
A
A
0.323
0.368
0.00E+00
4.38E-04
1.09E-13
0.318
0.498
G
G
0.323
0.368
0.00E+00
4.38E-04
1.09E-13
-0.318
-0.498
A
A
0.359
0.395
1.55E-15
3.26E-07
6.48E-10
0.125
0.215
A
A
0.359
0.394
2.00E-15
3.26E-07
8.12E-10
0.125
0.214
A
A
0.443
0.432
1.55E-15
1.75E-07
9.17E-10
-0.122
-0.257
A
A
0.443
0.432
2.44E-15
3.73E-04
1.17E-13
-0.301
-0.5
A
A
0.307
0.364
0.00E+00
2.59E-07
7.89E-10
0.133
0.232
C
A
0.484
0.491
4.44E-16
3.56E-07
1.08E-09
-0.12
-0.198
G
G
0.385
0.395
1.24E-14
1.93E-07
6.68E-10
0.126
0.191
G
G
0.266
0.273
7.62E-10
3.74E-04
2.43E-13
-0.32
-0.439
A
A
0.359
0.395
6.44E-15
4.50E-04
1.42E-13
0.277
0.444
A
A
0.359
0.394
8.44E-15
4.50E-04
1.96E-13
0.277
0.444
G
G
0.49
0.445
1.55E-12
3.09E-07
1.69E-09
0.122
0.173
A
A
0.307
0.364
9.99E-16
4.73E-04
1.49E-13
0.3
0.458
C
A
0.484
0.491
7.11E-15
4.80E-04
6.02E-14
-0.276
-0.439
G
G
0.266
0.273
1.17E-12
2.01E-07
8.98E-10
-0.106
-0.231
A
A
0.177
0.191
8.18E-11
2.47E-07
8.38E-10
0.143
0.232
G
G
0.385
0.395
3.33E-16
4.12E-04
1.67E-13
0.255
0.47
G
G
0.49
0.445
1.31E-11
4.96E-04
2.72E-13
0.276
0.377
A
A
0.177
0.191
4.36E-10
4.20E-04
2.40E-13
0.352
0.464
A
G
0.432
0.464
1.07E-14
9.73E-04
3.15E-04
0.497
0.527
A
G
0.432
0.459
4.69E-14
9.73E-04
1.99E-04
0.497
0.503
A
A
0.266
0.191
1.09E-11
9.51E-04
2.56E-04
-0.493
-0.69
G
G
0.266
0.191
1.09E-11
9.51E-04
2.56E-04
0.493
0.69
C
C
0.266
0.191
1.09E-11
9.51E-04
2.56E-04
0.493
0.69
A
A
0.271
0.174
7.41E-09
9.17E-04
1.68E-04
-0.494
-0.611
G
G
0.271
0.182
4.79E-10
9.17E-04
2.70E-04
0.494
0.649
G
G
0.271
0.186
9.35E-11
9.17E-04
2.53E-04
0.494
0.678
A
A
0.271
0.186
9.35E-11
9.17E-04
2.53E-04
-0.494
-0.678
G
G
0.271
0.182
4.79E-10
1.11E-03
2.70E-04
0.487
0.649
A
A
0.474
0.432
0.00E+00
2.89E-09
9.81E-09
-0.168
-0.227
A
A
0.479
0.432
0.00E+00
2.82E-09
9.81E-09
-0.164
-0.227
G
G
0.479
0.432
0.00E+00
2.82E-09
9.81E-09
0.164
0.227
C
A
0.495
0.459
0.00E+00
3.30E-09
9.82E-09
-0.162
-0.201
A
A
0.359
0.33
0.00E+00
2.77E-09
1.95E-08
-0.163
-0.253
G
G
0.385
0.355
0.00E+00
3.20E-09
1.01E-08
0.153
0.232
A
A
0.458
0.414
0.00E+00
3.09E-09
1.00E-08
-0.145
-0.202
A
A
0.234
0.286
0.00E+00
5.52E-03
1.80E-03
-0.082
-0.381
A
A
0.375
0.377
4.44E-16
3.01E-06
2.74E-10
1.102
1.304
G
G
0.448
0.432
0.00E+00
3.07E-06
2.20E-10
1.085
1.506
G
G
0.337
0.355
1.11E-16
3.07E-06
2.57E-10
-1.075
-1.349
G
G
0.495
0.464
0.00E+00
2.93E-06
1.65E-10
0.991
1.437
G
G
0.25
0.318
0.00E+00
7.07E-03
3.77E-15
0.41
0.566
A
A
0.25
0.318
0.00E+00
7.07E-03
3.77E-15
-0.41
-0.566
C
C
0.406
0.377
4.61E-10
2.41E-10
7.05E-09
-0.414
-0.218
C
C
0.411
0.394
3.53E-08
2.30E-10
1.02E-08
-0.397
-0.18
G
G
0.073
0.064
2.69E-09
3.37E-04
8.31E-05
-0.091
-0.106
G
G
0.073
0.064
2.69E-09
3.37E-04
8.31E-05
-0.091
-0.106
G
G
0.073
0.064
2.69E-09
3.37E-04
8.31E-05
-0.091
-0.106
A
A
0.38
0.414
7.77E-16
8.54E-07
5.19E-12
-0.356
-0.597
G
G
0.38
0.409
6.66E-16
8.34E-07
5.33E-12
0.379
0.589
A
A
0.375
0.409
5.33E-15
8.56E-07
4.82E-12
-0.346
-0.582
G
G
0.375
0.423
1.33E-13
8.56E-07
4.32E-12
0.346
0.542
A
A
0.375
0.418
2.09E-14
8.56E-07
3.98E-12
-0.346
-0.558
G
G
0.396
0.445
3.33E-16
8.10E-07
5.27E-12
0.38
0.541
G
G
0.396
0.445
3.33E-16
8.10E-07
5.27E-12
0.38
0.541
C
C
0.12
0.15
3.69E-13
1.02E-06
0.00E+00
-0.138
-0.24
A
A
0.211
0.259
0.00E+00
9.04E-06
1.81E-05
0.299
0.437
G
G
0.448
0.414
8.53E-09
3.06E-13
0.00E+00
0.345
0.282
A
A
0.422
0.436
5.86E-10
3.41E-13
0.00E+00
0.293
0.291
G
G
0.443
0.464
0.00E+00
1.01E-05
6.91E-09
0.074
0.167
G
G
0.443
0.464
2.22E-15
1.42E-03
7.89E-09
0.096
0.223
A
A
0.401
0.491
4.88E-10
1.48E-05
1.56E-08
-0.065
-0.139
A
A
0.401
0.491
1.58E-09
1.52E-03
7.26E-09
-0.101
-0.177
G
A
0.495
0.436
2.21E-08
1.42E-03
9.21E-09
0.086
0.177
G
A
0.495
0.436
3.42E-09
1.20E-05
6.98E-09
0.052
0.148
A
A
0.292
0.314
3.16E-11
1.42E-05
6.81E-09
0.072
0.149
A
A
0.292
0.314
1.46E-08
1.64E-03
1.14E-08
0.093
0.138
A
A
0.385
0.295
0.00E+00
2.16E-03
4.79E-07
0.139
0.178
A
A
0.375
0.295
0.00E+00
2.15E-03
4.79E-07
0.133
0.178
A
A
0.375
0.295
0.00E+00
2.15E-03
4.79E-07
0.133
0.178
G
G
0.391
0.295
0.00E+00
2.18E-03
4.79E-07
-0.13
-0.178
A
A
0.391
0.295
0.00E+00
2.18E-03
4.79E-07
0.13
0.178
G
G
0.391
0.295
0.00E+00
2.18E-03
4.79E-07
-0.13
-0.178
G
G
0.391
0.295
0.00E+00
2.18E-03
4.79E-07
-0.13
-0.178
C
C
0.391
0.295
0.00E+00
2.18E-03
4.79E-07
-0.13
-0.178
A
A
0.391
0.291
0.00E+00
2.18E-03
4.86E-07
0.13
0.185
G
G
0.391
0.3
0.00E+00
2.18E-03
4.86E-07
-0.13
-0.179
A
A
0.38
0.295
0.00E+00
2.18E-03
4.79E-07
0.124
0.178
G
G
0.38
0.295
0.00E+00
2.18E-03
4.79E-07
-0.124
-0.178
A
A
0.38
0.295
0.00E+00
2.18E-03
4.79E-07
0.124
0.178
A
A
0.365
0.295
0.00E+00
2.22E-03
4.79E-07
0.121
0.178
A
A
0.375
0.295
0.00E+00
2.17E-03
4.79E-07
0.122
0.178
C
C
0.385
0.314
0.00E+00
2.25E-03
4.70E-07
-0.116
-0.17
G
G
0.339
0.295
7.77E-15
2.17E-03
4.34E-07
-0.121
-0.151
A
A
0.396
0.3
1.46E-12
2.18E-03
4.09E-07
0.117
0.146
G
G
0.41
0.3
1.46E-12
1.75E-03
4.09E-07
-0.116
-0.146
C
C
0.406
0.282
1.04E-11
2.20E-03
4.16E-07
-0.115
-0.148
G
G
0.396
0.345
0.00E+00
2.28E-03
4.37E-07
-0.105
-0.158
A
A
0.323
0.259
1.50E-12
2.35E-03
4.61E-07
0.103
0.15
A
A
0.401
0.3
1.46E-12
2.21E-03
4.09E-07
0.108
0.146
G
G
0.401
0.3
1.46E-12
2.21E-03
4.09E-07
-0.108
-0.146
A
A
0.443
0.405
1.97E-13
2.22E-03
4.41E-07
0.104
0.138
A
A
0.12
0.123
1.69E-08
4.73E-03
7.99E-12
-0.464
-0.39
C
C
0.419
0.472
1.10E-14
1.75E-05
0.00E+00
-0.15
-0.281
A
A
0.417
0.473
6.22E-15
3.40E-05
0.00E+00
0.134
0.271
G
G
0.427
0.382
2.48E-10
7.08E-08
4.87E-06
-0.085
-0.103
G
G
0.427
0.391
6.36E-10
7.08E-08
4.95E-06
-0.085
-0.107
A
A
0.38
0.364
2.96E-09
6.04E-08
5.58E-06
0.099
0.135
A
A
0.29
0.284
0.00E+00
1.47E-05
2.79E-13
0.092
0.247
C
C
0.438
0.491
2.21E-12
0.00E+00
0.00E+00
-0.458
-0.442
G
G
0.438
0.491
2.21E-12
0.00E+00
0.00E+00
-0.458
-0.442
G
G
0.224
0.186
2.90E-13
2.51E-13
0.00E+00
0.269
0.411
G
G
0.167
0.15
4.63E-11
3.27E-13
0.00E+00
0.279
0.41
A
A
0.279
0.236
2.68E-08
5.51E-13
0.00E+00
-0.196
-0.278
A
A
0.411
0.382
2.49E-13
2.03E-13
0.00E+00
0.206
0.335
A
A
0.229
0.25
0.00E+00
2.61E-03
3.41E-05
0.732
1.214
A
A
0.193
0.218
0.00E+00
3.00E-03
3.19E-05
0.771
1.225
A
A
0.214
0.218
0.00E+00
2.37E-03
3.44E-05
0.699
1.135
A
A
0.411
0.464
4.38E-13
3.02E-03
3.66E-05
0.441
0.69
A
A
0.38
0.414
0.00E+00
1.65E-03
0.00E+00
-0.379
-0.576
C
C
0.396
0.427
0.00E+00
1.70E-03
0.00E+00
0.366
0.556
G
G
0.401
0.436
0.00E+00
1.70E-03
0.00E+00
0.359
0.546
G
G
0.401
0.436
0.00E+00
1.70E-03
0.00E+00
0.359
0.53
G
G
0.323
0.377
0.00E+00
1.81E-03
0.00E+00
0.389
0.527
A
A
0.323
0.377
0.00E+00
1.81E-03
0.00E+00
-0.389
-0.527
C
C
0.375
0.332
0.00E+00
1.56E-03
0.00E+00
0.393
0.504
C
C
0.38
0.341
0.00E+00
1.57E-03
0.00E+00
0.392
0.492
G
G
0.375
0.386
0.00E+00
1.67E-03
0.00E+00
0.368
0.52
A
A
0.271
0.245
0.00E+00
1.73E-03
0.00E+00
-0.403
-0.568
A
A
0.271
0.245
0.00E+00
1.73E-03
0.00E+00
-0.403
-0.568
A
A
0.312
0.286
1.33E-15
1.74E-03
0.00E+00
-0.399
-0.504
A
A
0.292
0.336
0.00E+00
1.81E-03
0.00E+00
-0.398
-0.562
A
A
0.276
0.245
0.00E+00
1.74E-03
0.00E+00
-0.397
-0.568
A
A
0.312
0.286
1.33E-15
1.72E-03
0.00E+00
-0.394
-0.504
A
A
0.297
0.295
1.44E-15
1.86E-03
0.00E+00
-0.382
-0.508
A
A
0.281
0.295
8.88E-16
1.82E-03
0.00E+00
-0.404
-0.525
A
A
0.307
0.341
0.00E+00
1.86E-03
0.00E+00
-0.373
-0.507
A
A
0.307
0.341
0.00E+00
1.86E-03
0.00E+00
-0.373
-0.507
C
C
0.318
0.359
0.00E+00
1.87E-03
0.00E+00
0.361
0.536
A
A
0.208
0.2
6.26E-11
1.78E-03
0.00E+00
-0.33
-0.534
G
G
0.188
0.159
7.13E-14
3.64E-08
4.77E-11
0.213
0.327
A
A
0.188
0.159
7.13E-14
3.64E-08
4.77E-11
-0.213
-0.327
A
A
0.12
0.068
4.87E-12
3.80E-03
9.50E-08
0.43
0.517
A
A
0.109
0.064
3.62E-11
3.87E-03
9.11E-08
0.426
0.5
G
G
0.438
0.423
1.01E-09
2.65E-06
0.00E+00
0.249
0.362
A
A
0.432
0.417
8.87E-10
2.72E-06
0.00E+00
-0.249
-0.365
A
A
0.432
0.418
1.70E-09
2.72E-06
0.00E+00
-0.249
-0.364
G
G
0.26
0.232
0.00E+00
9.63E-05
1.04E-12
0.371
0.437
A
A
0.182
0.195
0.00E+00
8.90E-05
1.34E-12
-0.406
-0.452
A
A
0.26
0.232
0.00E+00
9.63E-05
1.04E-12
-0.371
-0.437
G
G
0.292
0.271
1.11E-15
9.70E-05
1.99E-12
0.335
0.406
G
G
0.307
0.286
2.21E-12
9.61E-05
1.05E-12
0.305
0.335
C
C
0.312
0.291
7.65E-13
9.44E-05
9.81E-13
0.299
0.327
G
G
0.323
0.309
3.29E-11
9.64E-05
9.09E-13
0.278
0.325
G
G
0.323
0.305
1.99E-10
9.64E-05
9.18E-13
0.278
0.318
G
G
0.323
0.309
3.29E-11
9.64E-05
9.09E-13
0.278
0.325
G
G
0.323
0.309
3.29E-11
9.64E-05
9.09E-13
0.278
0.325
T
T
0.326
0.309
3.29E-11
8.01E-05
9.09E-13
0.273
0.325
A
A
0.318
0.291
8.16E-12
9.24E-05
8.77E-13
-0.275
-0.316
A
A
0.396
0.391
5.65E-11
2.16E-03
2.62E-06
0.295
0.442
G
G
0.396
0.391
5.65E-11
2.16E-03
2.62E-06
-0.295
-0.442
A
A
0.297
0.336
2.22E-16
7.50E-10
0.00E+00
-0.063
-0.129
A
A
0.297
0.341
5.55E-16
7.50E-10
0.00E+00
-0.063
-0.128
G
G
0.302
0.341
1.44E-15
7.40E-10
0.00E+00
0.06
0.124
A
A
0.359
0.368
6.99E-15
3.57E-04
2.42E-07
-0.102
-0.175
A
A
0.359
0.368
6.99E-15
3.57E-04
2.42E-07
-0.102
-0.175
G
G
0.495
0.455
0.00E+00
2.05E-08
1.78E-09
0.291
0.322
A
A
0.495
0.455
0.00E+00
2.05E-08
1.78E-09
-0.291
-0.322
G
G
0.495
0.455
0.00E+00
1.97E-08
1.70E-09
0.295
0.3
A
A
0.255
0.232
2.22E-16
1.49E-05
0.00E+00
-0.424
-0.541
C
C
0.255
0.232
2.22E-16
1.49E-05
0.00E+00
0.424
0.541
C
C
0.255
0.232
2.22E-16
1.49E-05
0.00E+00
0.424
0.541
G
G
0.253
0.232
2.22E-16
1.49E-05
0.00E+00
0.42
0.541
G
G
0.26
0.236
2.22E-16
1.51E-05
0.00E+00
0.402
0.535
A
A
0.089
0.114
0.00E+00
2.32E-05
0.00E+00
-0.396
-0.526
G
G
0.089
0.114
0.00E+00
2.32E-05
0.00E+00
0.396
0.526
A
A
0.089
0.114
0.00E+00
2.32E-05
0.00E+00
-0.396
-0.526
A
A
0.089
0.114
0.00E+00
2.32E-05
0.00E+00
-0.396
-0.526
G
G
0.089
0.114
0.00E+00
2.32E-05
0.00E+00
0.396
0.526
A
A
0.089
0.114
0.00E+00
2.32E-05
0.00E+00
-0.396
-0.526
C
C
0.089
0.114
0.00E+00
2.32E-05
0.00E+00
0.396
0.526
A
A
0.089
0.114
0.00E+00
2.32E-05
0.00E+00
-0.396
-0.526
G
G
0.083
0.095
0.00E+00
7.96E-03
4.79E-03
-0.307
-0.333
A
A
0.411
0.409
4.31E-12
1.22E-04
1.07E-03
0.178
0.286
A
A
0.411
0.414
8.90E-12
1.22E-04
1.07E-03
0.178
0.28
G
G
0.26
0.323
2.22E-09
1.22E-04
1.14E-03
-0.179
-0.25
G
G
0.177
0.159
2.22E-16
3.67E-06
4.25E-03
-0.138
-0.226
G
G
0.125
0.118
4.93E-11
3.37E-06
4.33E-03
-0.151
-0.203
A
A
0.198
0.236
1.16E-08
3.14E-06
4.23E-03
0.103
0.143
G
G
0.453
0.423
0.00E+00
3.33E-15
0.00E+00
0.318
0.395
A
A
0.406
0.445
2.78E-09
2.44E-15
0.00E+00
0.301
0.28
A
A
0.349
0.286
1.04E-09
3.33E-15
0.00E+00
-0.314
-0.316
A
A
0.151
0.195
4.12E-08
2.09E-06
1.59E-10
-0.237
-0.285

Interactive Table 2: Validated SNP-transcript pairs with evidence of an eQTL and a change in the magnitude of the genetic effect.


ProbeIDrsIDGeneIDMinor Allele (D)Minor Allele (V)MAF (D)MAF (V)pGene (D)pGene (V)R2 at Day 0 (D)R2 at Day 1 (D)R2 at Day 3 (D)R2 at Day 14 (D)Min MSEMax (Beta)Max DR2 (D)Max DR2 (V)
ILMN_1858599
2271811
G
G
0.453
0.432
1.58E-09
0.133
0.203
0.236
0.134
0.009
0.077
0.103
0.079
ILMN_1858599
289904
A
A
0.479
0.464
5.97E-09
0.134
0.279
0.197
0.11
0.009
0.093
0.146
0.083
ILMN_1796216
11626491
G
G
0.289
0.295
0
0.274
0.367
0.157
0.33
0.016
0.189
0.093
0.087
ILMN_1796216
10483877
G
G
0.26
0.241
0
0.389
0.476
0.247
0.468
0.013
0.213
0.087
0.108
ILMN_1773313
11191642
G
G
0.354
0.264
0
0.211
0.316
0.222
0.277
0.004
0.084
0.105
0.175
ILMN_1773313
7911488
G
G
0.354
0.268
0
0.211
0.316
0.222
0.277
0.004
0.084
0.105
0.226
ILMN_1738220
9369265
A
A
0.219
0.2
0
0.518
0.462
0.406
0.606
0.024
0.353
0.088
0.09
ILMN_1738220
7769759
G
G
0.219
0.2
0
0.518
0.462
0.406
0.606
0.024
0.353
0.088
0.09
ILMN_1738220
2101269
G
G
0.219
0.2
0
0.518
0.462
0.406
0.606
0.024
0.353
0.088
0.09
ILMN_1738220
1872241
A
A
0.208
0.2
0
0.549
0.482
0.445
0.631
0.023
0.377
0.081
0.09
ILMN_1759250
2857101
G
G
0.266
0.25
0
0.182
0.293
0.275
0.204
0.012
0.173
0.112
0.119
ILMN_1759250
2621321
G
G
0.266
0.25
0
0.182
0.293
0.275
0.204
0.012
0.173
0.112
0.119
ILMN_1759250
241456
A
A
0.266
0.245
0
0.182
0.293
0.275
0.204
0.012
0.173
0.112
0.121
ILMN_1759250
241454
G
G
0.266
0.245
0
0.182
0.293
0.275
0.204
0.012
0.173
0.112
0.121
ILMN_1759250
241453
A
A
0.266
0.245
0
0.182
0.293
0.275
0.204
0.012
0.173
0.112
0.121
ILMN_1759250
241449
A
A
0.266
0.245
0
0.182
0.293
0.275
0.204
0.012
0.173
0.112
0.121
ILMN_1759250
241448
G
G
0.266
0.245
0
0.182
0.293
0.275
0.204
0.012
0.173
0.112
0.121
ILMN_1759250
241447
G
G
0.266
0.245
0
0.182
0.293
0.275
0.204
0.012
0.173
0.112
0.121
ILMN_1759250
241446
A
A
0.266
0.245
0
0.182
0.293
0.275
0.204
0.012
0.173
0.112
0.121
ILMN_1759250
241445
A
A
0.266
0.245
0
0.182
0.293
0.275
0.204
0.012
0.173
0.112
0.121
ILMN_1759250
241441
G
G
0.271
0.245
0
0.174
0.293
0.267
0.211
0.012
0.173
0.12
0.121
ILMN_1759250
241440
A
A
0.271
0.245
0
0.174
0.293
0.267
0.211
0.012
0.173
0.12
0.121
ILMN_1659761
12931604
G
G
0.193
0.195
1.62E-10
0.16
0.309
0.185
0.255
0.012
0.133
0.148
0.138
ILMN_1659761
12928849
G
G
0.188
0.182
2.56E-09
0.153
0.294
0.148
0.241
0.012
0.13
0.141
0.162
ILMN_1659761
12920743
G
G
0.208
0.214
1.51E-09
0.142
0.256
0.142
0.279
0.013
0.133
0.137
0.129
ILMN_1659761
12918207
A
A
0.229
0.227
2.15E-09
0.193
0.335
0.145
0.287
0.012
0.126
0.142
0.13
ILMN_1659761
4781274
C
C
0.229
0.232
9.50E-10
0.193
0.335
0.145
0.287
0.012
0.126
0.142
0.136
ILMN_1659761
4781256
A
A
0.198
0.209
1.24E-08
0.142
0.297
0.149
0.238
0.012
0.13
0.154
0.197
ILMN_1659761
3826102
A
A
0.214
0.205
3.76E-12
0.195
0.356
0.182
0.258
0.011
0.132
0.16
0.104
ILMN_1659761
3826101
A
A
0.214
0.209
1.41E-12
0.195
0.356
0.182
0.258
0.011
0.132
0.16
0.108
ILMN_1659761
3826100
C
C
0.214
0.205
3.76E-12
0.195
0.356
0.182
0.258
0.011
0.132
0.16
0.104
ILMN_1659761
3803610
G
G
0.214
0.209
1.41E-12
0.195
0.356
0.182
0.258
0.011
0.132
0.16
0.108
ILMN_1659761
3803604
C
C
0.219
0.232
3.05E-12
0.214
0.378
0.204
0.257
0.011
0.136
0.164
0.121
ILMN_1659761
3169267
A
A
0.214
0.205
2.15E-13
0.195
0.356
0.182
0.258
0.011
0.132
0.16
0.118
ILMN_1659761
3169265
A
A
0.219
0.205
2.15E-13
0.174
0.311
0.171
0.231
0.012
0.12
0.137
0.118
ILMN_1659761
916097
A
A
0.172
0.145
2.85E-09
0.115
0.229
0.138
0.241
0.013
0.137
0.126
0.185
ILMN_1659761
890897
A
A
0.214
0.205
2.10E-12
0.195
0.356
0.182
0.258
0.011
0.132
0.16
0.132
ILMN_1659761
745829
C
C
0.214
0.205
3.76E-12
0.195
0.356
0.182
0.258
0.011
0.132
0.16
0.104
ILMN_1659761
10609
G
G
0.214
0.205
2.15E-13
0.195
0.356
0.182
0.258
0.011
0.132
0.16
0.118
ILMN_2368597
12753665
A
A
0.312
0.318
0
0.276
0.42
0.289
0.369
0.006
0.104
0.144
0.209
ILMN_2368597
11811630
A
A
0.432
0.468
0
0.233
0.317
0.215
0.348
0.006
0.089
0.115
0.093
ILMN_2368597
6662844
A
A
0.443
0.473
0
0.265
0.313
0.241
0.343
0.006
0.088
0.078
0.086
ILMN_2368597
2702204
G
G
0.349
0.362
0
0.256
0.345
0.336
0.313
0.007
0.094
0.089
0.151
ILMN_2368597
2275675
G
G
0.349
0.359
0
0.256
0.345
0.336
0.313
0.007
0.094
0.089
0.141
ILMN_2368597
2274064
G
G
0.432
0.468
0
0.233
0.317
0.215
0.348
0.006
0.089
0.115
0.109
ILMN_2368597
789172
C
C
0.443
0.482
0
0.265
0.313
0.241
0.343
0.006
0.088
0.078
0.086
ILMN_1683279
9471976
C
C
0.447
0.495
0
0.233
0.318
0.208
0.29
0.006
0.074
0.085
0.122
ILMN_1718932
326124
A
A
0.234
0.164
1.39E-13
0.223
0.21
0.156
0.334
0.03
0.205
0.111
0.079
ILMN_1652147
11190786
G
G
0.172
0.218
1.05E-12
0.303
0.421
0.304
0.273
0.002
0.067
0.118
0.103
ILMN_1652147
2863095
A
A
0.172
0.218
1.05E-12
0.303
0.421
0.304
0.273
0.002
0.067
0.118
0.103
ILMN_1652147
2295716
G
G
0.172
0.218
1.05E-12
0.303
0.421
0.304
0.273
0.002
0.067
0.118
0.103
ILMN_1652147
1056295
G
G
0.177
0.214
7.96E-13
0.277
0.467
0.317
0.274
0.002
0.069
0.19
0.09
ILMN_1652147
722435
A
A
0.172
0.218
1.05E-12
0.303
0.421
0.304
0.273
0.002
0.067
0.118
0.103
ILMN_1784428
17631676
G
G
0.214
0.164
4.60E-08
0.219
0.27
0.341
0.181
0.013
0.147
0.121
0.134
ILMN_1784428
12947718
A
A
0.214
0.164
4.60E-08
0.219
0.27
0.341
0.181
0.013
0.147
0.121
0.134
ILMN_1784428
11012
A
A
0.214
0.164
4.60E-08
0.219
0.27
0.341
0.181
0.013
0.147
0.121
0.134
ILMN_1664641
17071168
G
G
0.12
0.095
2.22E-16
0.208
0.187
0.203
0.306
0.026
0.214
0.099
0.1
ILMN_1664641
8002322
C
C
0.084
0.077
0
0.271
0.301
0.278
0.455
0.02
0.302
0.184
0.101
ILMN_1664641
7996051
G
G
0.068
0.064
0
0.289
0.337
0.264
0.511
0.018
0.368
0.222
0.108
ILMN_1664641
7982479
G
G
0.089
0.086
0
0.236
0.261
0.223
0.41
0.022
0.283
0.174
0.096
ILMN_1664641
7326381
A
A
0.068
0.064
0
0.289
0.337
0.264
0.511
0.018
0.368
0.222
0.108
ILMN_1664641
4941618
A
A
0.068
0.064
0
0.289
0.337
0.264
0.511
0.018
0.368
0.222
0.108
ILMN_1664641
1998989
A
A
0.068
0.073
0
0.289
0.337
0.264
0.511
0.018
0.368
0.222
0.1
ILMN_1664641
1410116
A
A
0.068
0.073
0
0.289
0.337
0.264
0.511
0.018
0.368
0.222
0.1
ILMN_2183938
10878255
A
A
0.37
0.332
4.42E-11
0.317
0.343
0.407
0.415
0.064
0.364
0.099
0.119
ILMN_2183938
10878233
A
A
0.359
0.332
4.02E-09
0.386
0.405
0.427
0.47
0.058
0.353
0.084
0.092
ILMN_2183938
7975588
A
A
0.365
0.332
4.02E-09
0.395
0.412
0.431
0.489
0.056
0.356
0.094
0.092
ILMN_2183938
7306826
G
G
0.365
0.323
3.52E-09
0.341
0.408
0.445
0.414
0.064
0.362
0.105
0.135
ILMN_2183938
3905826
C
C
0.359
0.332
4.02E-09
0.386
0.405
0.427
0.47
0.058
0.353
0.084
0.092
ILMN_1701512
12100841
G
G
0.182
0.186
9.99E-15
0.175
0.398
0.048
0.205
0.023
0.245
0.224
0.083
ILMN_1810628
683866
C
C
0.479
0.445
1.79E-10
0.188
0.184
0.179
0.272
0.003
0.05
0.084
0.147
ILMN_1810628
680775
A
A
0.302
0.264
0
0.296
0.379
0.357
0.451
0.002
0.069
0.155
0.121
ILMN_1810628
680729
A
A
0.3
0.264
0
0.295
0.379
0.354
0.449
0.003
0.069
0.155
0.121
ILMN_1810628
678943
G
G
0.333
0.35
7.96E-12
0.196
0.254
0.158
0.362
0.003
0.062
0.166
0.107
ILMN_1810628
620552
A
A
0.302
0.264
0
0.296
0.379
0.357
0.451
0.002
0.069
0.155
0.121
ILMN_1810628
611461
A
A
0.302
0.25
0
0.296
0.379
0.357
0.451
0.002
0.069
0.155
0.106
ILMN_1810628
577993
G
G
0.453
0.382
2.00E-12
0.2
0.2
0.218
0.289
0.003
0.052
0.09
0.116
ILMN_1810628
561970
A
A
0.302
0.264
0
0.296
0.379
0.357
0.451
0.002
0.069
0.155
0.121
ILMN_1810628
560094
G
G
0.302
0.264
0
0.296
0.379
0.357
0.451
0.002
0.069
0.155
0.121
ILMN_1810628
517634
A
A
0.302
0.264
0
0.296
0.379
0.357
0.451
0.002
0.069
0.155
0.121
ILMN_1810628
512110
G
G
0.302
0.264
0
0.296
0.379
0.357
0.451
0.002
0.069
0.155
0.121
ILMN_1719064
10774697
G
G
0.37
0.423
5.45E-10
0.213
0.266
0.273
0.296
0.019
0.135
0.084
0.086
ILMN_1733811
12452032
C
C
0.068
0.059
8.14E-11
0.209
0.303
0.335
0.292
0.051
0.52
0.126
0.119
ILMN_1733811
11079024
A
A
0.068
0.059
8.14E-11
0.209
0.303
0.335
0.292
0.051
0.52
0.126
0.119
ILMN_1733811
8071567
A
A
0.068
0.059
8.14E-11
0.209
0.303
0.335
0.292
0.051
0.52
0.126
0.119
ILMN_1733811
8065502
A
A
0.068
0.059
8.14E-11
0.209
0.303
0.335
0.292
0.051
0.52
0.126
0.119
ILMN_1733811
7216371
A
A
0.089
0.077
0
0.544
0.615
0.632
0.611
0.028
0.664
0.088
0.142
ILMN_1733811
4796743
A
A
0.073
0.059
8.14E-11
0.168
0.25
0.279
0.24
0.055
0.458
0.111
0.119
ILMN_1733811
4796712
A
A
0.083
0.082
0
0.257
0.374
0.422
0.379
0.045
0.53
0.165
0.15
ILMN_1733811
4796616
A
A
0.068
0.059
8.14E-11
0.209
0.303
0.335
0.292
0.051
0.52
0.126
0.119
ILMN_1733811
1436441
A
A
0.083
0.082
0
0.257
0.374
0.422
0.379
0.045
0.53
0.165
0.15
ILMN_1811468
748815
A
A
0.12
0.118
6.73E-12
0.118
0.221
0.272
0.268
0.004
0.104
0.154
0.102
ILMN_1670576
10239340
A
A
0.375
0.395
0
0.538
0.644
0.433
0.56
0.006
0.198
0.106
0.1
ILMN_1670576
9649520
A
A
0.49
0.495
0
0.431
0.558
0.349
0.419
0.008
0.18
0.127
0.082
ILMN_1670576
8043
A
A
0.49
0.495
0
0.431
0.558
0.349
0.419
0.008
0.18
0.127
0.082
ILMN_1810274
11079828
A
A
0.458
0.414
0
0.291
0.368
0.315
0.444
0.016
0.184
0.153
0.127
ILMN_1810274
11079824
C
A
0.495
0.459
0
0.361
0.422
0.351
0.49
0.015
0.194
0.13
0.141
ILMN_1810274
10853100
A
A
0.474
0.432
0
0.406
0.396
0.386
0.51
0.015
0.194
0.104
0.096
ILMN_1810274
2325948
G
G
0.479
0.432
0
0.394
0.399
0.396
0.512
0.015
0.192
0.118
0.096
ILMN_1810274
1042815
G
G
0.385
0.355
0
0.307
0.374
0.328
0.442
0.016
0.189
0.134
0.086
ILMN_1810274
925284
A
A
0.479
0.432
0
0.394
0.399
0.396
0.512
0.015
0.192
0.118
0.096
ILMN_1808405
9273012
G
G
0.25
0.318
0
0.209
0.307
0.144
0.22
0.224
0.539
0.098
0.084
ILMN_1808405
9272219
A
A
0.25
0.318
0
0.209
0.307
0.144
0.22
0.224
0.539
0.098
0.084
ILMN_2150787
9264508
A
A
0.198
0.195
1.24E-11
0.385
0.567
0.444
0.342
0.005
0.16
0.182
0.121
ILMN_2150787
3130695
A
A
0.191
0.187
8.48E-11
0.367
0.475
0.382
0.241
0.006
0.152
0.108
0.148
ILMN_2150787
3130542
A
A
0.198
0.195
1.24E-11
0.385
0.567
0.444
0.342
0.005
0.16
0.182
0.121
ILMN_2150787
2524074
G
G
0.266
0.318
0
0.451
0.547
0.43
0.335
0.005
0.147
0.096
0.24
ILMN_1651496
1009181
G
G
0.401
0.395
2.31E-10
0.13
0.295
0.194
0.374
0.063
0.31
0.245
0.082
ILMN_1651496
806973
G
G
0.411
0.409
2.05E-10
0.139
0.289
0.233
0.338
0.06
0.299
0.199
0.079
ILMN_1655525
2294155
G
G
0.146
0.123
1.44E-14
0.177
0.208
0.186
0.292
0.005
0.097
0.115
0.112
ILMN_1673370
4270584
G
G
0.406
0.327
4.38E-09
0.237
0.331
0.18
0.113
0.015
0.124
0.094
0.087
ILMN_1779147
17645885
G
G
0.104
0.1
4.33E-15
0.285
0.361
0.296
0.398
0.021
0.28
0.113
0.106
ILMN_1678766
9457413
C
C
0.419
0.472
1.10E-14
0.105
0.197
0.254
0.152
0.088
0.232
0.149
0.074
ILMN_1678766
6925536
A
A
0.417
0.473
6.22E-15
0.08
0.18
0.223
0.162
0.089
0.226
0.143
0.093
ILMN_1767651
6951479
G
G
0.427
0.382
2.48E-10
0.16
0.228
0.208
0.258
0.014
0.103
0.099
0.097
ILMN_1767651
954050
G
G
0.427
0.391
6.36E-10
0.16
0.228
0.208
0.258
0.014
0.103
0.099
0.081
ILMN_1704985
10189479
A
A
0.396
0.368
5.33E-15
0.222
0.308
0.394
0.346
0.091
0.364
0.172
0.091
ILMN_1704985
4674321
G
G
0.406
0.373
2.22E-16
0.277
0.327
0.422
0.405
0.082
0.383
0.145
0.087
ILMN_1704985
4674305
G
G
0.396
0.377
2.22E-16
0.248
0.311
0.408
0.394
0.084
0.371
0.16
0.096
ILMN_1704985
3821031
A
A
0.365
0.35
1.61E-13
0.214
0.234
0.338
0.352
0.09
0.326
0.138
0.073
ILMN_1704985
2710251
G
G
0.427
0.386
2.22E-16
0.296
0.34
0.419
0.391
0.084
0.367
0.124
0.083
ILMN_1704985
2556388
G
G
0.427
0.386
2.22E-16
0.296
0.34
0.419
0.391
0.084
0.367
0.124
0.083
ILMN_1704985
2278530
G
G
0.406
0.377
0
0.277
0.327
0.422
0.405
0.082
0.383
0.145
0.077
ILMN_1704985
1344642
A
A
0.427
0.381
4.44E-16
0.296
0.34
0.419
0.391
0.084
0.367
0.124
0.095
ILMN_1704985
1055816
G
G
0.406
0.377
0
0.277
0.327
0.422
0.405
0.082
0.383
0.145
0.077
ILMN_1704985
612874
A
A
0.406
0.377
0
0.277
0.327
0.422
0.405
0.082
0.383
0.145
0.077
ILMN_1704985
611203
G
G
0.406
0.373
2.22E-16
0.277
0.327
0.422
0.405
0.082
0.383
0.145
0.087
ILMN_1704985
523396
A
A
0.406
0.373
2.22E-16
0.277
0.327
0.422
0.405
0.082
0.383
0.145
0.087
ILMN_1704985
492400
G
G
0.406
0.377
0
0.277
0.327
0.422
0.405
0.082
0.383
0.145
0.077
ILMN_1723115
17719042
G
G
0.276
0.241
4.86E-08
0.171
0.212
0.252
0.183
0.003
0.067
0.081
0.112
ILMN_1723115
10206319
A
A
0.286
0.236
2.90E-11
0.205
0.234
0.307
0.159
0.003
0.084
0.102
0.204
ILMN_1723115
1548891
A
A
0.323
0.277
2.22E-16
0.25
0.357
0.442
0.275
0.003
0.092
0.193
0.16
ILMN_1723115
1548888
C
C
0.323
0.277
2.22E-16
0.25
0.357
0.442
0.275
0.003
0.092
0.193
0.16
ILMN_1665457
10744034
A
A
0.469
0.455
2.22E-16
0.35
0.431
0.305
0.411
0.009
0.121
0.081
0.128
ILMN_1665457
6488608
A
A
0.385
0.395
0
0.421
0.521
0.445
0.457
0.007
0.126
0.101
0.093
ILMN_1714592
4655226
A
A
0.12
0.068
4.87E-12
0.162
0.242
0.146
0.198
0.102
0.491
0.081
0.122
ILMN_1714592
3102071
A
A
0.109
0.064
3.62E-11
0.149
0.225
0.137
0.243
0.097
0.488
0.094
0.155
ILMN_1787529
11057065
G
G
0.302
0.341
1.44E-15
0.123
0.224
0.222
0.255
0.013
0.117
0.131
0.239
ILMN_1787529
10846411
A
A
0.297
0.341
5.55E-16
0.131
0.228
0.225
0.26
0.013
0.121
0.129
0.254
ILMN_1787529
2072449
A
A
0.297
0.336
2.22E-16
0.131
0.228
0.225
0.26
0.013
0.121
0.129
0.252
ILMN_1675483
7603521
A
A
0.161
0.191
1.18E-13
0.182
0.356
0.292
0.247
0.016
0.176
0.174
0.097
ILMN_1675483
3821348
A
A
0.161
0.2
3.11E-15
0.182
0.356
0.292
0.247
0.016
0.176
0.174
0.1

Interactive Table 3: Gene expression correlates of the antibody response to influenza vaccination.


Illumina Probe IDGene SymbolDay of Maximum CorrelationMax Pearson Correlation
Day1
0.35
Day1
0.35
Day1
0.34
Day1
0.33
Day1
0.33
Day1
0.33
Day1
0.33
Day1
0.32
Day1
0.32
Day1
0.32
Day1
0.31
Day1
0.31
Day1
0.31
Day1
0.31
Day1
0.31
Day1
0.3
Day1
0.3
Day1
0.3
Day1
0.3
Day1
0.3
Day1
0.3
Day1
0.3
Day1
0.3
Day1
0.29
Day3
0.29
Day1
0.29
Day1
0.29
Day1
0.29
Day1
0.29
Day1
0.29
Day1
0.28
Day1
0.28
Day1
0.28
Day1
0.28
Day1
0.28
Day1
0.28
Day1
0.28
Day1
0.28
Day1
0.28
Day1
0.28
Day1
0.28
Day1
0.28
Day1
0.28
Day1
0.28
Day1
0.28
Day1
0.28
Day1
0.28
Day1
0.28
Day1
0.27
Day1
0.27
Day1
0.27
Day1
0.27
Day1
0.27
Day14
0.27
Day1
0.27
Day0
0.27
Day1
0.27
Day1
0.27
Day1
0.27
Day1
0.27
Day1
0.27
Day1
0.26
Day0
0.26
Day1
0.26
Day1
0.26
Day1
0.26
Day14
0.26
Day1
0.26
Day1
0.26
Day1
0.26
Day1
0.26
Day14
0.26
Day1
0.26
Day1
0.25
Day1
0.25
Day1
0.25
Day1
0.25
Day1
0.25
Day0
0.25
Day1
0.25
Day1
0.25
Day1
0.25
Day14
0.25
Day0
0.24
Day1
0.24
Day1
0.24
Day1
0.24
Day1
0.24
Day1
0.24
Day1
0.24
Day14
0.24
Day1
0.24
Day1
0.24
Day1
0.24
Day1
0.24
Day14
0.24
Day1
0.24
Day1
0.24
Day0
0.24
Day14
0.24
Day14
0.24
Day1
0.23
Day3
0.23
Day1
0.23
Day1
0.23
Day1
0.23
Day14
0.23
Day1
0.23
Day1
0.23
Day3
0.23
Day1
0.23
Day3
0.23
Day3
0.23
Day1
0.23
Day1
0.23
Day14
0.23
Day1
0.22
Day1
0.22
Day1
0.22
Day0
0.22
Day14
0.22
Day0
0.22
Day1
0.22
Day1
0.22
Day14
0.22
Day1
0.22
Day1
0.22
Day1
0.22
Day0
0.22
Day1
0.22
Day1
0.22
Day1
0.22
Day3
0.22
Day14
0.21
Day1
0.21
Day1
0.21
Day1
0.21
Day1
0.21
Day1
0.21
Day1
0.21
Day1
0.21
Day1
0.21
Day1
0.21
Day3
0.21
Day1
0.21
Day14
0.21
Day1
0.21
Day3
0.21
Day1
0.21
Day1
0.21
Day3
0.21
Day1
0.2
Day1
0.2
Day0
0.2
Day1
0.2
Day1
0.2
Day14
0.2
Day0
0.2
Day0
0.2
Day1
0.2
Day1
0.2
Day1
0.2
Day3
0.2
Day1
0.2
Day1
0.2
Day0
0.2
Day1
0.2
Day0
0.2
Day0
0.2
Day1
0.2
Day1
0.2
Day3
0.2
Day1
0.2
Day14
0.2
Day1
0.19
Day3
0.19
Day14
0.19
Day3
0.19
Day1
0.19
Day3
0.19
Day14
0.19
Day3
0.19
Day14
0.19
Day0
0.19
Day1
0.19
Day14
0.19
Day1
0.19
Day3
0.19
Day14
0.18
Day0
0.18
Day1
0.18
Day0
0.18
Day0
0.18
Day0
0.18
Day3
0.18
Day0
0.18
Day1
0.18
Day1
0.18
Day14
0.18
Day1
0.17
Day14
0.17
Day1
0.17
Day1
0.17
Day0
0.17
Day0
0.17
Day1
0.17
Day0
0.17
Day3
0.17
Day3
0.16
Day3
0.16
Day1
0.16
Day1
0.16
Day0
0.16
Day1
0.15
Day1
0.15
Day1
0.15
Day14
0.15
Day1
0.15
Day1
-0.15
Day14
-0.15
Day14
-0.15
Day14
-0.15
Day1
-0.16
Day14
-0.16
Day1
-0.16
Day1
-0.17
Day14
-0.18
Day1
-0.18
Day14
-0.18
Day1
-0.18
Day1
-0.19
Day1
-0.19
Day0
-0.19
Day1
-0.19
Day1
-0.19
Day14
-0.19
Day1
-0.19
Day1
-0.19
Day1
-0.19
Day14
-0.2
Day14
-0.2
Day1
-0.2
Day0
-0.2
Day0
-0.2
Day14
-0.2
Day0
-0.2
Day1
-0.21
Day0
-0.21
Day14
-0.21
Day0
-0.21
Day0
-0.22
Day0
-0.22
Day14
-0.22
Day14
-0.22
Day0
-0.22
Day0
-0.22
Day0
-0.22
Day0
-0.22
Day1
-0.22
Day14
-0.22
Day14
-0.22
Day14
-0.22
Day14
-0.22
Day0
-0.23
Day1
-0.23
Day1
-0.23
Day0
-0.23
Day0
-0.23
Day14
-0.23
Day14
-0.23
Day0
-0.23
Day1
-0.23
Day14
-0.23
Day1
-0.23
Day14
-0.23
Day0
-0.23
Day14
-0.23
Day1
-0.23
Day14
-0.23
Day0
-0.24
Day1
-0.24
Day14
-0.24
Day3
-0.24
Day0
-0.24
Day14
-0.24
Day1
-0.24
Day0
-0.24
Day14
-0.24
Day14
-0.24
Day14
-0.25
Day14
-0.25
Day0
-0.25
Day0
-0.25
Day0
-0.25
Day14
-0.25
Day14
-0.26
Day14
-0.26
Day0
-0.26
Day14
-0.27
Day3
-0.28
Day0
-0.29